Предыстория первого и второго сезона «Сказание о демонах сакуры». Юкимура Чизуру приехала в Киото в поисках своего отца - доктора, который пропал без вести. В первую же ночь столичной жизни Чизуру стала свидетелем жестокой схватки двух групп самураев. Победители обнаружили ее и взяли в плен. Каково же было удивление девушки, когда она узнала, что попала в руки Синсенгуми - самоназванных хранителей порядка в Киото. Когда они узнают, что она дочь доктора, которого Синсенгуми тоже ищут, герои решают помочь ей с поисками.